海軍軍醫(yī)大學創(chuàng)建于1949年9月，當時稱華東軍區(qū)人民醫(yī)學院，主要由華東醫(yī)務(wù)干部學校、第三野戰(zhàn)軍衛(wèi)生部醫(yī)學院、國民黨原國防醫(yī)學院部分留大陸人員和從地方招聘的專家教授組成。1950年10月，更名為上海軍醫(yī)大學。1951年7月9日，由中央軍委正式命名為中國人民解放軍第二軍醫(yī)大學。2017年6月29日，更名為中國人民解放軍海軍軍醫(yī)大學，并對外保留第二軍醫(yī)大學校名。中國人民解放軍海軍軍醫(yī)大學，簡稱海軍軍醫(yī)大學（第二軍醫(yī)大學），國家“211工程”、軍隊“2110工程”和原總后勤部“530工程”重點建設(shè)院校，首批國家“雙一流”世界一流學科建設(shè)高校，軍隊研究生培養(yǎng)重點建設(shè)院校，是軍隊3所設(shè)置研究生院的單位之一，是全國首批博士、碩士學位授予單位和首批開辦八年制醫(yī)學教育的高校，入選教育部“卓越醫(yī)生教育培養(yǎng)計劃”、國家建設(shè)高水平大學公派研究生項目、國家生命科學與技術(shù)人才培養(yǎng)基地、外軍醫(yī)學留學生培養(yǎng)基地。在滬附屬醫(yī)院有上海長海醫(yī)院、上海長征醫(yī)院、東方肝膽外科醫(yī)院、上海市浦東新區(qū)公利醫(yī)院。